查干湖自然保护区是吉林省人民政府1986年批准成立的省级自然保护区。保护区面积为480平方公里,大部分在开发区境内。 保护区核心区位于辛甸泡,泡内生满芦苇,是鸟类主要栖息场所;缓冲区位于查干湖夹芯子岛以北至辛甸泡水域;生产实验区位于新庙泡、库里泡、菱角泡和查干湖夹芯子岛以南水域。 保护区内现有鸟类有15目34科116种,占全省鸟类总数的35.6%,其中水鸟有13科58种,占本区鸟类总种数的50%。属国家Ⅰ级保护的有白枕鹤、白头鹤、丹顶鹤等5种;属国家Ⅱ级保护的有白天鹅、雀鹰、灰鹤等12种。 两栖类有1目3科4种,爬行类有2目3科4种,兽类4目9科22种。 鱼类15科38种,主要有鲤、草、鲢、鳙、鲫、红鳍鱼、青鱼、鲶鱼、黄颡、鳌花鱼、武昌鱼等。 随着环境保护工作的不断开展,全区植树造林面积逐年增加,植被得到恢复,湖泊塌岸得到治理,鸟类数量也明显增加。中华秋沙鸭、白天鹅等国家级重点保护鸟类年年来保护区栖息和繁殖。
每年6月,在查干湖都会举行查干湖蒙古族民俗旅游节,此节庆也是2006年度中国十大民俗类节庆之一,仅闻此名,值得期待。
查干湖的旅游旺季是冬季和夏秋两季。查干湖的冬捕是世界独有的,许多国内外人世都慕名而来。夏季水草丰美,烟波浩淼。秋天雁鸭栖息、蒲苇轻拂鱼戏浪,又是不一样的景色。